Parallèlement, des fonds sont recherchés pour l'acquisition de ces locaux. En 2003, 700 m2 de locaux administratifs sont acquis à Aubonne (Suisse), à mi-chemin entre Genève et Lausanne. Un mix de prêts privés (avec ou sans intérêts) et de prêts bancaires permettent de concrétiser le projet. En novembre 2003, les premiers locataires emménagent dans les locaux.
Les locaux seront inaugurés en janvier 2004, avec quatorze entreprises locataires et en présence du syndic Pierre-Alain Blanc et de l'ancien syndic Armin Suter. Un demi-millier de personnes participent à la journée portes ouvertes.
Première extension en 2006
En 2006, Innov.ch acquiert dans les mêmes bâtiments une surface complémentaire de 400 m2 pour faire face à l'augmentation des demandes de locaux. Ces derniers seront ensuite revendus à une école privée.
Deuxième extension en 2007
Un an plus tard, nouvelle extension, de 200m2, toujours dans les mêmes locaux. Innov.ch dispose désormais à Aubonne d'un peu plus de 1300 m2 de locaux administratifs.
Création d'Innov.ch à Lausanne
En 2009, la fondation Innov.ch est interpellée par une organisation chrétienne pour reproduire le modèle et acquérir des locaux administratifs à Lausanne. Très rapidement l'idée de créer un nouveau pôle d'Innov.ch s'impose. 450 m2 sont acquis au courant de l'automne. Les premiers locataires emménagent début décembre. Là encore, ce projet a pu être concrétisé grâce à un prêt privé sans intérêt. Ce projet a permis à une demi-douzaine d'entreprises et organisations chrétiennes de partager des locaux et développer des synergies durant plusieurs années. Les locaux seront ensuite revendus à l'un des locataires, la Ligue pulmonaire, en 2020. Cette dernière continuera d'héberger certaines organisations bénéficiaires de ce projet.
Que ce soit à Aubonne ou à Lausanne, la vision de départ a pu être poursuivie : appliquer des principes éprouvés de gestion d'entreprise, tels que le développement de synergies et la mise en commun d'infrastructures pouvant être partagées, afin de gagner en efficacité et grandir en intelligence collective. Mutualiser des investissements qui auraient été impossibles pour une seule organisation. Plusieurs dizaines d'entreprises, organisations et projets ont bénéficié des infrastructures et du soutien de la fondation Innov.ch.
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